Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SALL3Q9BXA9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms