Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW4

SSBP3, Single-stranded DNA-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3Q9BWW4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms