Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NDC1Q9BTX1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms