Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COPS4Q9BT78 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms