Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSM1

PCGF1, Polycomb group RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF1Q9BSM1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF1Q9BSM1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms