Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYD88Q99836 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms