Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms