Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TNFRSF13CQ96RJ3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms