Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRERF1Q96PN7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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