Protein–RNA interactions for Protein: Q96PL1

SCGB3A2, Secretoglobin family 3A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB3A2Q96PL1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCGB3A2Q96PL1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCGB3A2Q96PL1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCGB3A2Q96PL1 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCGB3A2Q96PL1 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCGB3A2Q96PL1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCGB3A2Q96PL1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCGB3A2Q96PL1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCGB3A2Q96PL1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCGB3A2Q96PL1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SCGB3A2Q96PL1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCGB3A2Q96PL1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCGB3A2Q96PL1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCGB3A2Q96PL1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCGB3A2Q96PL1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCGB3A2Q96PL1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCGB3A2Q96PL1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCGB3A2Q96PL1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCGB3A2Q96PL1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCGB3A2Q96PL1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCGB3A2Q96PL1 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCGB3A2Q96PL1 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SCGB3A2Q96PL1 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCGB3A2Q96PL1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCGB3A2Q96PL1 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCGB3A2Q96PL1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCGB3A2Q96PL1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCGB3A2Q96PL1 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCGB3A2Q96PL1 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCGB3A2Q96PL1 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCGB3A2Q96PL1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SCGB3A2Q96PL1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCGB3A2Q96PL1 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCGB3A2Q96PL1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCGB3A2Q96PL1 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms