Protein–RNA interactions for Protein: Q96NE9

FRMD6, FERM domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD6Q96NE9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FRMD6Q96NE9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms