Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP53Q96M91 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms