Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM47Q96LD4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM47Q96LD4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms