Protein–RNA interactions for Protein: Q96HR3

MED30, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 30, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED30Q96HR3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED30Q96HR3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED30Q96HR3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED30Q96HR3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED30Q96HR3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED30Q96HR3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED30Q96HR3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED30Q96HR3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED30Q96HR3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED30Q96HR3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED30Q96HR3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED30Q96HR3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED30Q96HR3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED30Q96HR3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED30Q96HR3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED30Q96HR3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED30Q96HR3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED30Q96HR3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED30Q96HR3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED30Q96HR3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MED30Q96HR3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MED30Q96HR3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MED30Q96HR3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MED30Q96HR3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MED30Q96HR3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MED30Q96HR3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MED30Q96HR3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MED30Q96HR3 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED30Q96HR3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms