Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UTP4Q969X6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms