Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GTF3AQ92664 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GTF3AQ92664 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GTF3AQ92664 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF3AQ92664 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF3AQ92664 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF3AQ92664 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF3AQ92664 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF3AQ92664 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF3AQ92664 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF3AQ92664 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF3AQ92664 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF3AQ92664 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF3AQ92664 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF3AQ92664 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF3AQ92664 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF3AQ92664 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF3AQ92664 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF3AQ92664 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF3AQ92664 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF3AQ92664 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF3AQ92664 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF3AQ92664 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF3AQ92664 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF3AQ92664 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF3AQ92664 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF3AQ92664 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF3AQ92664 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF3AQ92664 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF3AQ92664 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF3AQ92664 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms