Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB9

RHBDD1, Rhomboid-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1Q8TEB9 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDD1Q8TEB9 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms