Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC112Q8NEF3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms