Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

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Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TTC21AQ8NDW8 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TTC21AQ8NDW8 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
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