Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8I0

SAMD12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD12Q8N8I0 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAMD12Q8N8I0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms