Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYNE4Q8N205 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYNE4Q8N205 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYNE4Q8N205 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNE4Q8N205 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNE4Q8N205 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNE4Q8N205 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNE4Q8N205 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNE4Q8N205 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNE4Q8N205 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNE4Q8N205 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNE4Q8N205 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNE4Q8N205 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNE4Q8N205 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNE4Q8N205 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNE4Q8N205 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNE4Q8N205 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNE4Q8N205 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNE4Q8N205 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNE4Q8N205 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNE4Q8N205 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNE4Q8N205 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNE4Q8N205 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNE4Q8N205 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNE4Q8N205 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNE4Q8N205 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNE4Q8N205 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNE4Q8N205 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNE4Q8N205 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNE4Q8N205 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNE4Q8N205 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNE4Q8N205 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNE4Q8N205 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNE4Q8N205 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNE4Q8N205 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNE4Q8N205 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNE4Q8N205 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNE4Q8N205 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNE4Q8N205 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms