Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LMNTD2Q8IXW0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMNTD2Q8IXW0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms