Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC84Q86UT8 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms