Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RUFY3Q7L099 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms