Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PREX2Q70Z35 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PREX2Q70Z35 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PREX2Q70Z35 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PREX2Q70Z35 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms