Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAXIP1Q6ZW49 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms