Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVN7

SEM1, Putative protein SEM1, isoform 2, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEM1Q6ZVN7 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SEM1Q6ZVN7 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SEM1Q6ZVN7 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms