Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CASC2Q6XLA1 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms