Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC21.33■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L3Q6VB84 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms