Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC3HQ6NTF7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms