Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ECM29Q5VYK3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms