Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SAMD13Q5VXD3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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SAMD13Q5VXD3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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SAMD13Q5VXD3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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SAMD13Q5VXD3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAMD13Q5VXD3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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