Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT5

MYOM3, Myomesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOM3Q5VTT5 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYOM3Q5VTT5 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYOM3Q5VTT5 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
MYOM3Q5VTT5 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYOM3Q5VTT5 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYOM3Q5VTT5 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYOM3Q5VTT5 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYOM3Q5VTT5 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYOM3Q5VTT5 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYOM3Q5VTT5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYOM3Q5VTT5 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYOM3Q5VTT5 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYOM3Q5VTT5 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
MYOM3Q5VTT5 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
MYOM3Q5VTT5 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
MYOM3Q5VTT5 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYOM3Q5VTT5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms