Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFT2D3Q587I9 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D3Q587I9 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms