Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLHL22Q53GT1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms