Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RFTN2Q52LD8 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RFTN2Q52LD8 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms