Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC153Q494R4 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms