Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC21.33■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FOXD4L6Q3SYB3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms