Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00303Q3SY05 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms