Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EDRF1Q3B7T1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms