Protein–RNA interactions for Protein: Q30154

HLA-DRB5, HLA class II histocompatibility antigen, DR beta 5 chain, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DRB5Q30154 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HLA-DRB5Q30154 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DRB5Q30154 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms