Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KLHL40Q2TBA0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms