Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
KNOP1Q1ED39 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
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