Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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SGCAQ16586 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SGCAQ16586 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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SGCAQ16586 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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SGCAQ16586 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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SGCAQ16586 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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