Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABRA6Q16445 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRA6Q16445 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms