Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC6Q16204 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC6Q16204 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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