Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITSN1Q15811 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
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