Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRADDQ15628 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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