Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDGFRLQ15198 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms