Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PCLAFQ15004 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCLAFQ15004 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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